Dans Prototype, le joueur incarnera Alex Mercer, un héros doté de super pouvoirs mystérieux. Les origines de ces facultés hors du commun restent inconnues, mais Mercer est bien décidé à suivre la moindre piste pour enfin trouver ce qui lui est arrivé et exercer sa colère pour se venger. Après quoi, il ira voir les graphistes de Radical Entertainment pour leur demander pourquoi les textures des images et vidéos diffusées aujourd'hui bavent et sont affichées en basse résolution. Espérons que le rendu du jeu final soit plus abouti à sa sortie en juin sur PC,Playstation 3 et Xbox 360.